最明显的两点：首先，他对于“漫画杂志”，特别是“漫画周刊”这种当年新起的连载方式早期重视度不够，依然抱持着每部作品的读者每两三年就会变化流动一次的想法在创作。所以他其实并没有真正专注于创作出足够的长篇故事——《阿童木》，《黑杰克》是短篇集，《火鸟》是中篇集，正儿八经的长篇如《佛陀》，《向阳之树》篇幅都不长，这对于他想描绘的内容是个很大限制。
比如《向阳之树》，这部作品的主题几乎可以看做村上纪香《仁医》（20卷）+《龙》（42卷）的合体，而他居然在11卷里就让故事结束了，即使以他的编剧能力也是捉襟见肘的。另外，他被人吐槽比较多的喜欢大开杀戒这点，除了本身的艺术追求和时代标准之外，不想拉长剧情所以果断砍掉配角也是原因之一。
同时，他又习惯于同一时间连载多部作品来把剩余时间填满，具体到创作上就是他会用降低作品精度的方式来保证速度，比如他的绝技同时画三部漫画，这对单部作品的质量难免会有影响——他会在的作品在出单行本时进行大规模的加笔甚至重画，而这又反过来占用了他画连载作品的时间。
第二，他大概从二十世纪七十年代开始就无法掌握少年漫画市场的流行了。那时正是运动漫画和格斗漫画兴起的时候，而手塚虫师这辈子什么题材都画过，就是拿运动漫和格斗漫没辙。之后他虽然凭借《黑杰克》又杀了回来，但他最开始是把《黑杰克》当少年漫画在创作的，而这部漫画当时在日本少年儿童中的反响并不好，主要读者实际上是青年人群，这也看出他对当时少年儿童的阅读喜好已经抓不准了。
借用虫师自己的话来说
